本课程提供对细菌序列数据进行基于基因组学的常见分析任务的演示和练习。 课程使用 BV-BRC，即细菌和病毒生物信息学资源中心（Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center，由 PATRIC、IRD 和 ViPR 这三个前资源合并而成）作为分析平台。BV-BRC 是由 NIH/NIAID 资助的细菌生物信息学资源中心，提供全面的细菌基因组数据以及综合分析工具和可视化工具。BV-BRC 还提供了一个私人工作区，用户可以在此上传和分析自己的数据。 课程参与者将从原始序列数据开始，获得对细菌基因组进行比较分析所需的技能。第一模块的课程包括基因组组装、注释、系统发生树构建和蛋白质家族/蛋白质组比较。第一模块的课程包括基因组组装、注释、系统进化树构建和蛋白质家族/蛋白质组比较。每一课都是在前一课的基础上进行的，从而创建了一个完整的基线分析工作流程。 注：本课程中的练习是使用 BV-BRC 的前身 PATRIC 系统开发的。不过，BV-BRC 是在 PATRIC 的基础上构建的，因此大部分内容仍然相同。
细菌生物信息学
您将学到什么
学习如何组装细菌基因组
学习如何注释细菌基因组
学习如何从一组细菌基因组生成系统发生树
学习如何对一组细菌基因组进行基本的比较分析
要了解的详细信息
作业
8 项作业
授课语言：英语（English）
了解顶级公司的员工如何掌握热门技能
该课程共有8个模块
位教师
授课教师评分
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Birla Institute of Technology & Science, Pilani
Technical University of Denmark (DTU)
University of Toronto
University of Toronto
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学生评论
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AS
已于 Feb 6, 2024审阅
It is really good...got to learn more about health informatics
AA
已于 Apr 4, 2025审阅
I have learnt so much from this course, although I am yet to complete it. Thumps up to Rebecca Wattam and PATRIC.org
PP
已于 Dec 23, 2020审阅
very useful course , can solve a lot of problem in bacterium genome analysis easily
