Researcher's guide to omic fundamentals

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Researcher's guide to omic fundamentals

Ce cours fait partie de Spécialisation "Researcher's Guide to Omic Data"

Instructeur : Candace Savonen, MS

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Inclus avec

5 modules

Obtenez un aperçu d'un sujet et apprenez les principes fondamentaux.

18 avis

niveau Intermédiaire

Expérience recommandée

4 heures à compléter

Planning flexible

Apprenez à votre propre rythme

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Ce que vous apprendrez

By the end of the course you will confidently be able to use tutorials and resources to understand and interpret your genomic data.

Compétences que vous acquerrez

Catégorie : Data Processing
Catégorie : Data Analysis
Catégorie : Molecular Biology
Catégorie : Data Literacy
Catégorie : Metadata Management
Catégorie : Exploratory Data Analysis
Catégorie : Bioinformatics
Catégorie : Data Quality
Catégorie : Scientific Methods

Outils que vous découvrirez

Catégorie : R Programming

Détails à connaître

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Évaluations

15 devoirs

Enseigné en Anglais

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Il y a 5 modules dans ce cours

The course is intended for students in the biomedical sciences and researchers who have been given data and don’t know what to do with it or would like an overview of the different genomic data types that are out there.

This course is written for individuals who: - Have genomic data and don’t know what to do with it. - Want a basic overview of genomic data types. - Want to find resources for processing and interpreting genomics data. Goal of this course: Equip learners with tutorials and resources so they can understand and interpret their genomic data in a way that helps them meet their goals and handle the data properly. This includes helping learners formulate questions they will need to ask others about their data What is not the goal Teach learners about choosing parameters or about the ins and outs of every genomic tool they might be interested in. This course is meant to connect people to other resources that will help them with the specifics of their genomic data and help learners have more efficient and fruitful discussions about their data with bioinformatic experts. The course is intended for students in the biomedical sciences who have been given data and don’t know what to do with it or would like an overview of the different genomic data types that are out there.

In this module, we cover the basics of what will be covered in this course and what you should expect. Next we get into an overview of what omic data types and their workflows often look like.

Inclus

3 vidéos3 lectures2 devoirs1 sujet de discussion

3 vidéos Total 5 minutes

Welcome! 2 minutes
Intro to this course 1 minute
Summary: Overview of genomic workflows 2 minutes

3 lectures Total 15 minutes

Introduction 5 minutes
Video Review of What is a Genome 5 minutes
A very general overview of genomic data 5 minutes

2 devoirs Total 11 minutes

A very general overview of genomic data 5 minutes
A very general overview of genomic data 6 minutes

1 sujet de discussion Total 10 minutes

What are your goals for this course? 10 minutes

In this module, we cover some considerations for how to choose between different omics tools. Then we talk about what is metadata and how do you make sure you get the most of your metadata?

Inclus

2 vidéos2 lectures4 devoirs2 sujets de discussion

2 vidéos Total 3 minutes

Summary: Considerations for choosing tools 1 minute
Summary: Guidelines for Good Metadata 2 minutes

2 lectures Total 10 minutes

Considerations for choosing tools 5 minutes
Guidelines for Good Metadata 5 minutes

4 devoirs Total 37 minutes

Considerations for choosing tools 5 minutes
Guidelines for Good Metadata 5 minutes
Considerations for choosing tools 15 minutes
Guidelines for Good Metadata 12 minutes

2 sujets de discussion Total 10 minutes

Considerations for your project 5 minutes
Good Metadata Manuscript 5 minutes

In this module, we build on the previous module's generalities about omic data and get into specifics about sequencing data and microarray data.

Inclus

2 vidéos2 lectures4 devoirs

2 vidéos Total 5 minutes

Summary: Fundamentals of Sequencing Data 2 minutes
Summary: Fundamentals of Microarray Data 3 minutes

2 lectures Total 17 minutes

Sequencing Data 10 minutes
Fundamentals of Microarray Data 7 minutes

4 devoirs Total 36 minutes

Sequencing Data 5 minutes
Fundamentals of Microarray Data 5 minutes
Sequencing Data 20 minutes
Fundamentals of Microarray Data 6 minutes

In this module, we discuss what are general data analysis tools you may want to consider using. Lastly we cover some basics about annotation that are involved in every omic data analysis workflow.

Inclus

1 vidéo3 lectures4 devoirs

Now that you've learned some fundamentals about omic data, in this section we have a final quiz that tests your absorption of what we've discussed. We also have a Tool Glossary of recommended tools you may want to consider using for your next steps with your omic data.

Inclus

1 vidéo2 lectures1 devoir

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