Researcher's guide to DNA sequencing data

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Researcher's guide to DNA sequencing data

Ce cours fait partie de Spécialisation "Researcher's Guide to Omic Data"

Instructeur : Candace Savonen, MS

Inclus avec

7 modules

Obtenez un aperçu d'un sujet et apprenez les principes fondamentaux.

niveau Intermédiaire

Expérience recommandée

6 heures à compléter

Planning flexible

Apprenez à votre propre rythme

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Ce que vous apprendrez

You will be able to understand the goals and general workflows of DNA based methods and know tools and resources you should consider.

Compétences que vous acquerrez

Catégorie : Data Collection
Catégorie : Molecular Biology
Catégorie : Research Design
Catégorie : Bioinformatics
Catégorie : Laboratory Techniques
Catégorie : Analysis
Catégorie : Research
Catégorie : Data Processing

Détails à connaître

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13 devoirs

Enseigné en Anglais

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Il y a 7 modules dans ce cours

This course is a follow up course to "Researcher's Guide to Fundamentals of Omic Data" which dives into further detail about DNA informatics methods!

This course is for individuals who: - Have taken Researcher's Guide to Fundamentals of Omic Data - Have DNA data and don’t know what to do with it. - Want a basic overview of their DNA focused data type. - Want to find resources for processing and interpreting DNA data What this course will cover: - Fundamentals of DNA methods. - Resources you may consider looking into for your own purposes. - Questions you should ask yourself and your colleagues about your goals and experimental design. What this course will NOT cover: - Code needed to process your data. - Details about every type of experimental design. - Everything you’d need to know to make you a computational biologist. In other words we still highly encourage you to consult your informatics and computational colleagues, especially those who may have done any handling of data you are trying to learn about.

In this module we discuss what this course covers and encourage you to make your own goals for what you'd like to learn. Then we start with some generalities about DNA focused methods.

Inclus

3 vidéos3 lectures2 devoirs1 sujet de discussion

3 vidéos Total 6 minutes

Welcome! 1 minute
Intro to this course 1 minute
DNA Overview 4 minutes

3 lectures Total 19 minutes

Considerations for your DNA goals 5 minutes
Video covering types of mutations 2 minutes
DNA Overview 12 minutes

2 devoirs Total 11 minutes

DNA Overview 5 minutes
DNA Overview 6 minutes

1 sujet de discussion Total 15 minutes

Goals for this course 15 minutes

In this module we cover the details of whole genome sequencing and whole exome sequencing. We compare and contrast the methods and discuss what kinds of questions these data types might answer.

Inclus

2 lectures2 devoirs1 sujet de discussion

In this section we dive into DNA methylation sequencing methods, also known more specifically as bisulfite sequencing.

Inclus

2 lectures2 devoirs1 sujet de discussion

In this section we cover the basics of chromatin evaluation methods. We contrast and compare chromatin sequencing methods.

Inclus

1 vidéo2 lectures2 devoirs1 sujet de discussion

In this module, we discuss details of the different ways chromatin can be assessed. We go through the basics of ATAC-seq, and scRNA-seq.

Inclus

2 vidéos3 lectures2 devoirs

In this section we cover the basics of ChIP-seq and CUT & Tag and CUT & RUN.

Inclus

1 vidéo4 lectures2 devoirs

In this section, In this module we discuss when microarrays should be used for assaying DNA instead of sequencing methods. and then we will wrap up this course with a final quiz to assess your absorption of the material. We also point you to our Tool Glossary that has a list of tools you may want to consider for your next steps of your DNA omics study.

Inclus

3 lectures1 devoir2 sujets de discussion

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Instructeur

Candace Savonen, MS

Fred Hutchinson Cancer Center

13 Cours 8 596 apprenants

Offert par

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Researcher's guide to RNA sequencing data
Cours
Fred Hutchinson Cancer Center
Researcher's guide to omic fundamentals
Cours
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Introduction to Genomic Technologies
Cours
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Algorithms for DNA Sequencing
Cours

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