Researcher's guide to omic fundamentals

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Researcher's guide to omic fundamentals

Dieser Kurs ist Teil von Spezialisierung „Researcher's Guide to Omic Data“

Dozent: Candace Savonen, MS

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5 Module

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18 Bewertungen

Stufe Mittel

Empfohlene Erfahrung

4 Stunden zu vervollständigen

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Was Sie lernen werden

By the end of the course you will confidently be able to use tutorials and resources to understand and interpret your genomic data.

Kompetenzen, die Sie erwerben

Kategorie: Molecular Biology
Kategorie: Data Processing
Kategorie: Bioinformatics
Kategorie: Exploratory Data Analysis
Kategorie: Data Quality
Kategorie: Scientific Methods
Kategorie: Data Literacy
Kategorie: Data Analysis
Kategorie: Metadata Management

Werkzeuge, die Sie lernen werden

Kategorie: R Programming

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15 Aufgaben

Unterrichtet in Englisch

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Dieser Kurs ist Teil der Spezialisierung Spezialisierung „Researcher's Guide to Omic Data“

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In diesem Kurs gibt es 5 Module

The course is intended for students in the biomedical sciences and researchers who have been given data and don’t know what to do with it or would like an overview of the different genomic data types that are out there.

This course is written for individuals who: - Have genomic data and don’t know what to do with it. - Want a basic overview of genomic data types. - Want to find resources for processing and interpreting genomics data. Goal of this course: Equip learners with tutorials and resources so they can understand and interpret their genomic data in a way that helps them meet their goals and handle the data properly. This includes helping learners formulate questions they will need to ask others about their data What is not the goal Teach learners about choosing parameters or about the ins and outs of every genomic tool they might be interested in. This course is meant to connect people to other resources that will help them with the specifics of their genomic data and help learners have more efficient and fruitful discussions about their data with bioinformatic experts. The course is intended for students in the biomedical sciences who have been given data and don’t know what to do with it or would like an overview of the different genomic data types that are out there.

In this module, we cover the basics of what will be covered in this course and what you should expect. Next we get into an overview of what omic data types and their workflows often look like.

Das ist alles enthalten

3 Videos3 Lektüren2 Aufgaben1 Diskussionsthema

3 Videos Insgesamt 5 Minuten

Welcome! 2 Minuten
Intro to this course 1 Minute
Summary: Overview of genomic workflows 2 Minuten

3 Lektüren Insgesamt 15 Minuten

Introduction 5 Minuten
Video Review of What is a Genome 5 Minuten
A very general overview of genomic data 5 Minuten

2 Aufgaben Insgesamt 11 Minuten

A very general overview of genomic data 5 Minuten
A very general overview of genomic data 6 Minuten

1 Diskussionsthema Insgesamt 10 Minuten

What are your goals for this course? 10 Minuten

In this module, we cover some considerations for how to choose between different omics tools. Then we talk about what is metadata and how do you make sure you get the most of your metadata?

Das ist alles enthalten

2 Videos2 Lektüren4 Aufgaben2 Diskussionsthemen

2 Videos Insgesamt 3 Minuten

Summary: Considerations for choosing tools 1 Minute
Summary: Guidelines for Good Metadata 2 Minuten

2 Lektüren Insgesamt 10 Minuten

Considerations for choosing tools 5 Minuten
Guidelines for Good Metadata 5 Minuten

4 Aufgaben Insgesamt 37 Minuten

Considerations for choosing tools 5 Minuten
Guidelines for Good Metadata 5 Minuten
Considerations for choosing tools 15 Minuten
Guidelines for Good Metadata 12 Minuten

2 Diskussionsthemen Insgesamt 10 Minuten

Considerations for your project 5 Minuten
Good Metadata Manuscript 5 Minuten

In this module, we build on the previous module's generalities about omic data and get into specifics about sequencing data and microarray data.

Das ist alles enthalten

2 Videos2 Lektüren4 Aufgaben

2 Videos Insgesamt 5 Minuten

Summary: Fundamentals of Sequencing Data 2 Minuten
Summary: Fundamentals of Microarray Data 3 Minuten

2 Lektüren Insgesamt 17 Minuten

Sequencing Data 10 Minuten
Fundamentals of Microarray Data 7 Minuten

4 Aufgaben Insgesamt 36 Minuten

Sequencing Data 5 Minuten
Fundamentals of Microarray Data 5 Minuten
Sequencing Data 20 Minuten
Fundamentals of Microarray Data 6 Minuten

In this module, we discuss what are general data analysis tools you may want to consider using. Lastly we cover some basics about annotation that are involved in every omic data analysis workflow.

Das ist alles enthalten

1 Video3 Lektüren4 Aufgaben

Now that you've learned some fundamentals about omic data, in this section we have a final quiz that tests your absorption of what we've discussed. We also have a Tool Glossary of recommended tools you may want to consider using for your next steps with your omic data.

Das ist alles enthalten

1 Video2 Lektüren1 Aufgabe

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Dozent

Lehrkraftbewertungen

(5 Bewertungen)

Candace Savonen, MS

Fred Hutchinson Cancer Center

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Spezialisierung

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Felipe M.

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