Diese Lektion enthält eine Schritt-für-Schritt-Anleitung für die Assemblierung eines Genoms aus einer Reihe von bakteriellen Sequenzleseproben mit dem BV-BRC Genome Assembly Service. Es sind Übungen enthalten, um das Verständnis zu verbessern und den Assemblierungsprozess zu üben. Beachten Sie, dass die Übungen mit PATRIC, dem Vorgängersystem von BV-BRC, entwickelt wurden. BV-BRC wurde jedoch auf der Grundlage von PATRIC entwickelt, so dass der Inhalt größtenteils gleich geblieben ist.

Diese Lektion enthält eine Schritt-für-Schritt-Anleitung für die Annotation eines Genoms aus Contigs unter Verwendung des BV-BRC Bacterial Genome Annotation Service. Es sind Übungen enthalten, um das Verständnis zu verbessern und den Annotationsprozess zu üben. Beachten Sie, dass die Übungen mit PATRIC, dem Vorgängersystem von BV-BRC, entwickelt wurden. BV-BRC wurde jedoch auf der Grundlage von PATRIC entwickelt, so dass der Inhalt größtenteils gleich geblieben ist.

Diese Lektion enthält eine Schritt-für-Schritt-Anleitung für das Assemblieren, Kommentieren und Durchführen einer automatisierten Analyse eines Genoms aus einem Satz bakterieller Sequenzleseproben mit dem BV-BRC Comprehensive Genome Analysis Service. Es sind Übungen enthalten, um das Verständnis zu verbessern und den Umgang mit dem Dienst zu üben. Beachten Sie, dass die Übungen mit PATRIC, dem Vorgängersystem von BV-BRC, entwickelt wurden. BV-BRC wurde jedoch auf der Grundlage von PATRIC entwickelt, so dass der Inhalt größtenteils gleich geblieben ist.

Diese Lektion enthält eine Schritt-für-Schritt-Anleitung zur Erstellung eines codonbasierten Stammbaums aus einer Reihe von Genomen mit dem BV-BRC Codon Tree Service. Es sind Übungen enthalten, um das Verständnis zu verbessern und den Umgang mit dem Dienst zu üben. Beachten Sie, dass die Übungen mit PATRIC, dem Vorgängersystem von BV-BRC, entwickelt wurden. BV-BRC wurde jedoch auf der Grundlage von PATRIC entwickelt, so dass der Inhalt größtenteils gleich geblieben ist.

Diese Lektion enthält eine Schritt-für-Schritt-Anleitung für die Suche nach Genomen (und der zugehörigen Taxonomie) in BV-BRC, die Ihrem Genom oder Ihren Sequenzen ähnlich sind, unter Verwendung des Similar Genome Finder Service. Es sind Übungen enthalten, um das Verständnis zu verbessern und den Umgang mit dem Dienst zu üben. Beachten Sie, dass die Übungen mit PATRIC, dem Vorgängersystem von BV-BRC, entwickelt wurden. BV-BRC wurde jedoch auf der Grundlage von PATRIC entwickelt, so dass der Inhalt größtenteils gleich geblieben ist.

Diese Lektion enthält eine Schritt-für-Schritt-Anleitung zur Verwendung des BV-BRC Protein Family Sorter, um das Vorhandensein, die Abwesenheit und die Anzahl von Proteinen in Proteinfamilien in einer Reihe von Genomen zu vergleichen. Es sind Übungen enthalten, um das Verständnis zu verbessern und den Umgang mit dem Tool zu üben. Beachten Sie, dass die Übungen mit PATRIC, dem Vorgängersystem von BV-BRC, entwickelt wurden. BV-BRC wurde jedoch auf der Grundlage von PATRIC entwickelt, so dass der Inhalt größtenteils gleich geblieben ist.

Diese Lektion enthält eine Schritt-für-Schritt-Anleitung zur Verwendung des BV-BRC Proteome Comparison Service, um einen Satz von Genomen mit einem Referenzgenom, einer Merkmalsgruppe oder einer FASTA-Datei zu vergleichen. Es sind Übungen enthalten, um das Verständnis zu verbessern und den Umgang mit dem Tool zu üben. Beachten Sie, dass die Übungen mit PATRIC, dem Vorgängersystem von BV-BRC, entwickelt wurden. BV-BRC wurde jedoch auf der Grundlage von PATRIC entwickelt, so dass der Inhalt größtenteils gleich geblieben ist.