在本专业的上一门课程中，我们学习了如何比较基因、蛋白质和基因组。 我们使用这些方法的一种方式是构建 "生命之树"，以展示大量相关生物是如何随着时间的推移而进化的。 在课程的前半部分，我们将讨论构建进化树的方法，这些方法已成为有史以来被引用次数最多的科学论文的主题，并展示它们如何解决从寻找致命病毒的起源到定位现代人类的发源地等各种难题。 在课程的后半部分，我们将转换思路，研究鸟类是由恐龙进化而来的这一古老说法。 我们如何证明这一点呢？ 特别是，我们将研究一项成果，该成果称从霸王龙化石中提取的肽与鸡体内发现的肽非常吻合。最后，您将学习如何应用流行的生物信息学软件工具来重建埃博拉病毒的进化树，并确定最近引起全球关注的埃博拉疫情的源头。
分子进化（生物信息学 IV）
分子进化（生物信息学 IV）
本课程是 生物信息学 专项课程 的一部分
位教师：Pavel Pevzner
访问权限由 New York State Department of Labor 提供
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- 获得对主题或工具的基础理解
- 通过实践项目培养工作相关技能
- 获得可共享的职业证书
该课程共有6个模块
<p>欢迎来到我们的课堂！</p><p>在这门课上，我们将探讨以下两个核心的生物学问题（括号中显示了解决这些问题所需的计算方法）：</p><ol><li>第1-3周：是哪种动物给我们带来了SARS？ (<i>进化树构建</i>)</li><li>第4-5周：<em>霸王龙</em>只是一只大鸡吗？ （<em>组合算法</em>）</li></ol><p>在第 6 周，您将完成生物信息学应用挑战，应用进化树构建算法来确定非洲最近爆发的埃博拉疫情的起源。</p><p>与以前的课程一样，这两章中的每一章都配有天才艺术家兰德尔-克里斯托弗创作的生物信息学漫画，并作为本专业畅销书<a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">印刷版</a>的章首。您可以在本消息底部找到第一章的漫画。粘虫和蝙蝠与致命病毒有什么关系？如何利用生物信息学来阻止这些病毒？今天就开始学习，一探究竟！</p><p><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/evolution_cropped.jpg" title="图片: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/evolution_cropped.jpg" width="528"></p>
涵盖的内容
5个视频2篇阅读材料1个作业2个应用程序项目
</p> <p>欢迎来到第 2 周课堂！</p> <p>上周，我们开始了解如何通过距离矩阵构建进化树。 </p> <p>本周，我们将遇到更多用于此目的的算法，包括邻接算法，该算法自 30 年前问世以来，已成为科学界引用次数最多的十大论文之一。
涵盖的内容
3个视频1篇阅读材料1个作业2个应用程序项目
</p> <p>欢迎来到第 3 周的课堂！</p> <p>在过去的两周中，我们已经学习了几种不同的算法，用于从距离矩阵中构建进化树。</p> <p>本周，我们将结束本章的学习，考虑如果我们使用称为 "特征 "的属性来代替距离会发生什么。我们还将了解如何推断进化树中生物的祖先状态，并考虑是否有可能为这项任务定义一种高效的算法。
涵盖的内容
4个视频1篇阅读材料1个作业2个应用程序项目
<p>欢迎来到第4周的课堂！</p> <p>鸟类是由恐龙进化而来的吗？在接下来的两周里，我们将看看如何分析分子证据来支持这一理论。您可以在本 E-mail 的底部找到兰德尔-克里斯托弗（Randall Christopher）本周的生物信息学漫画。为什么霸王龙看起来那么像鸡？为什么猴子在疯狂地打字？继续学下去就知道了！</p> <p><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/proteomics_cropped.jpg" title="图片: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/proteomics_cropped.jpg" width="528"></p>
涵盖的内容
4个视频1个作业2个应用程序项目
<p>欢迎来到第 5 周的课堂！</p> <p>上周，我们提出了恐龙肽是否有可能在化石中存活 6500 万年的问题。本周，我们将看看这个问题与统计学有什么关系；在这个过程中，我们将看看如何利用猴子在打字机上打出的符号来解决这个问题。
涵盖的内容
5个视频1个作业2个应用程序项目
<p>欢迎来到本课程的第六周，也是最后一周！</p> <p>在本周的生物信息学应用挑战中，我们将重建伊波拉病毒的进化树，并用它来确定导致最近非洲疫情爆发的病原体的起源。
涵盖的内容
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位教师
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已于 Dec 4, 2016审阅
At some point several instructors lost necessary passion to keep us focused. Otherwise it was a very informed and enjoyable presentation. Historical references are extremely important.
RG
已于 Jul 19, 2017审阅
Covers the most important algorithms for phylogenetic trees. Fascinating exam
ZX
已于 Jul 20, 2019审阅
In depth and comprehensive coverage of the topics in genetic data analysis.
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¹ 本课程的部分作业采用 AI 评分。对于这些作业，将根据 Coursera 隐私声明使用您的数据。