基因组测序及其开创个性化医疗时代的潜力，您可能已有所耳闻，但基因组测序意味着什么呢？ 生物学家仍然无法像阅读一本书那样，从头到尾阅读整个基因组的核苷酸。不过，他们可以读取短小的 DNA 片段。在本课程中，我们将了解如何利用图论从这些短片组装基因组。我们还将进一步学习蛮力算法，并将其应用于名为抗生素的微型蛋白质的测序。
基因组测序（生物信息学 II）
基因组测序（生物信息学 II）
本课程是 生物信息学 专项课程 的一部分
位教师：Pavel Pevzner
访问权限由 New York State Department of Labor 提供
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本课程是 生物信息学 专项课程 专项课程的一部分
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- 向行业专家学习新概念
- 获得对主题或工具的基础理解
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该课程共有5个模块
<p>欢迎来到课堂！</p><p>本课程将重点讨论现代计算生物学最前沿的两个问题，以及我们将用来解决这些问题的算法方法：</p><ol><li>第1-2周：我们如何组装基因组？(<i>图算法</i>）</li><li>我们如何对抗生素进行测序？(<i>蛮力算法</i>)</li></ol><p>课程中的每两章内容都配有天才圣地亚哥艺术家兰德尔-克里斯托弗（Randall Christopher）创作的生物信息学漫画，并在专业畅销书<a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">印刷版</a>中作为章节标题。您可以在本消息底部找到第一章的漫画。1735 年的时光机旅行、一叠报纸、一幅拼图和一只入侵河边城市的大蚂蚁与拼凑基因组有什么关系？今天就开始学习，找出答案！</p><p><img src="https://d396qusza40orc.cloudfront.net/bioinformatics%2Fimages%2Fchapter4_final_lr.jpg" title="图片: https://d396qusza40orc.cloudfront.net/bioinformatics%2Fimages%2Fchapter4_final_lr.jpg" width="528"></p>
涵盖的内容
8个视频2篇阅读材料1个作业2个应用程序项目
<p> 欢迎来到第 2 周课堂！</p> <p>本周课堂上，我们将了解一个已有 300 年历史的数学定理如何帮助我们从数百万个 DNA 小片中组装出基因组。
涵盖的内容
5个视频1篇阅读材料1个作业2个应用程序项目
<p>欢迎来到第 3 周的课堂！</p> <p>本周，我们将开始新的一章，题目是 "我们如何对抗生素进行测序？" 在本章中，我们将学习 如何使用蛮力算法确定组成抗生素的氨基酸序列。</p> <p>下面是本周的生物信息学漫画。</p> <p><img src="https://d396qusza40orc.cloudfront.net/bioinformatics%2Fimages%2Fchapter2_final.jpg" title="图片: https://d396qusza40orc.cloudfront.net/bioinformatics%2Fimages%2Fchapter2_final.jpg" width="528"></p>
涵盖的内容
5个视频1篇阅读材料1个作业2个应用程序项目
<p>欢迎来到第 4 周的课堂！</p> <p>上周，我们讨论了如何根据理想光谱对抗生素肽进行测序。本周，我们将了解如何为抗生素肽测序开发更复杂的算法，以处理含有大量错误和缺失质量的光谱。
涵盖的内容
4个视频1篇阅读材料1个作业2个应用程序项目
欢迎来到第 5 周的课堂！本周，我们将了解如何将基因组组装工具应用于危险致病菌的测序数据。
涵盖的内容
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Felipe M.
自 2018开始学习的学生
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QL
已于 Aug 27, 2017审阅
It would be great if all the slides for every week could be shared. The Bioinformatics II is much harder than the last level. They've made it easy to learn.
ZX
已于 Jul 20, 2019审阅
In depth and comprehensive coverage of the topics in genetic data analysis.
BN
已于 Aug 5, 2020审阅
Really enjoyed the course. Dropped from five to four stars because the final challenge introduced several new concepts rather than integrating concepts taught throughout the class.
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¹ 本课程的部分作业采用 AI 评分。对于这些作业，将根据 Coursera 隐私声明使用您的数据。