University of California San Diego

查找 DNA 和蛋白质中的突变(生物信息学 VI)

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University of California San Diego

查找 DNA 和蛋白质中的突变(生物信息学 VI)

本课程是 生物信息学 专项课程 的一部分

Pavel  Pevzner
Phillip Compeau

位教师:Pavel Pevzner

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深入了解一个主题并学习基础知识。
4.6

(61 条评论)

中级 等级
需要一些相关经验
2 周 完成
在 10 小时 一周
灵活的计划
自行安排学习进度
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授课语言:英语(English)

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积累特定领域的专业知识

本课程是 生物信息学 专项课程 专项课程的一部分
在注册此课程时,您还会同时注册此专项课程。
  • 向行业专家学习新概念
  • 获得对主题或工具的基础理解
  • 通过实践项目培养工作相关技能
  • 获得可共享的职业证书

该课程共有6个模块

<p>欢迎来到我们的课堂!</p><p>在这堂课上,我们将探讨以下两个核心的生物学问题(括号中显示的是解决这两个问题所需的计算方法):</p><ol><li>我们如何定位致病突变?(<em>组合模式匹配</em>)</li><li>为什么生物学家仍未开发出艾滋病毒疫苗?&nbsp;(<em>隐藏马尔可夫模型</em>)</li></ol><p>和以前的课程一样,这两章中的每一章都配有天才艺术家兰德尔-克里斯托弗(Randall Christopher)创作的生物信息学漫画,并作为专业畅销书<a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">印刷版</a>的章首。您可以在本消息底部找到第一章的漫画。</p><p><img src="https://stepic.org/media/attachments/lessons/292/chapter7_cropped.jpg" title="图片: https://stepic.org/media/attachments/lessons/292/chapter7_cropped.jpg" width="528"></p>

涵盖的内容

4个视频2篇阅读材料1个作业2个应用程序项目

<p>Welcome to week 2 of the class! </p> <p>本周,我们将介绍一种名为 Burrows-Wheeler 变换的范式;在了解它如何用于字符串压缩后,我们将证明它也是现代读映射算法的基础。

涵盖的内容

3个视频1篇阅读材料2个应用程序项目

<p>欢迎来到第 3 周课堂!</p> <p>上周,我们了解了如何将 Burrows-Wheeler 变换应用于多重模式匹配。 本周,我们将加速我们的算法,并将其推广到模式有错误的情况,这模拟了将有错误的读数映射到参考基因组的生物学问题。

涵盖的内容

4个视频1篇阅读材料1个作业2个应用程序项目

</p> <p>欢迎来到第 4 周的课堂!</p> <p>本周,我们将开始研究具有许多突变的序列(例如来自不同 HIV 株系的相关基因)的比对情况,并发现我们的序列比对问题表述不足以解决高度差异化的序列。</p> <p>为了改进我们的算法,我们将引入一种称为隐马尔可夫模型的机器学习范例,并了解动态编程如何帮助我们回答有关这些模型的问题。

涵盖的内容

5个视频2个应用程序项目

<p>欢迎来到第 5 周的课堂!</p> <p>上周,我们介绍了隐马尔可夫模型。 本周,我们将了解如何将隐马尔可夫模型应用于使用轮廓 HMM 的序列比对。 然后,我们将考虑该领域的一些高级课题,这些课题与我们在上一门课程中考虑的高级聚类方法有关。

涵盖的内容

5个视频1篇阅读材料1个作业2个应用程序项目

<p>欢迎来到第六周,也是最后一周的课堂!</p> <p>本周是应用挑战赛,我们将应用已开发的 HMM 序列比对算法。

涵盖的内容

1次同伴评审

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位教师

授课教师评分
4.6 (5个评价)
Pavel  Pevzner
University of California San Diego
16 门课程 896,136 名学生
Phillip Compeau
University of California San Diego
8 门课程 318,335 名学生

提供方

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人们为什么选择 Coursera 来帮助自己实现职业发展

Felipe M.
自 2018开始学习的学生
''能够按照自己的速度和节奏学习课程是一次很棒的经历。只要符合自己的时间表和心情,我就可以学习。'
Jennifer J.
自 2020开始学习的学生
''我直接将从课程中学到的概念和技能应用到一个令人兴奋的新工作项目中。'
Larry W.
自 2021开始学习的学生
''如果我的大学不提供我需要的主题课程,Coursera 便是最好的去处之一。'
Chaitanya A.
''学习不仅仅是在工作中做的更好:它远不止于此。Coursera 让我无限制地学习。'

学生评论

4.6

61 条评论

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EJ
5

已于 Jul 31, 2021审阅

SC
5

已于 Jun 30, 2020审阅

TK
5

已于 Jun 28, 2016审阅

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常见问题

¹ 本课程的部分作业采用 AI 评分。对于这些作业,将根据 Coursera 隐私声明使用您的数据。