L'objectif de ce cours est de présenter aux apprenants des packages R open-source qui peuvent être utilisés pour effectuer des tâches de reporting de données cliniques. L'accent principal du cours sera mis sur le flux de données cliniques, des données brutes (CRF et non-CRF) au SDTM, à l'ADaM et aux résultats finaux. Plusieurs outils open source permettant de réaliser ces tâches seront présentés, mais l'objectif de ce cours n'est pas de devenir un expert dans l'un ou l'autre de ces outils, mais plutôt d'initier les participants aux concepts plus larges qui sous-tendent ces tâches. De cette façon, les outils servent simplement d'exemple de la façon dont les concepts sous-jacents peuvent être mis en action dans le Code.

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(14 avis)
Expérience recommandée
Compétences que vous acquerrez
- Catégorie : Présentation des données
- Catégorie : Communication technique
- Catégorie : Gestion des données cliniques
- Catégorie : Rapports statistiques
- Catégorie : Shiny (Package (R))
- Catégorie : Science des données
- Catégorie : Manipulation de données
- Catégorie : Importation/exportation de données
- Catégorie : Produits pharmaceutiques
- Catégorie : Visualisation interactive des données
- Catégorie : R (logiciel)
- Catégorie : Essais cliniques
- Catégorie : Visualisation de Données
- Catégorie : Modélisation des données
- Catégorie : La programmation en R
- Catégorie : Développement de médicaments
- Catégorie : Transformation de données
- Catégorie : Programmation Statistique
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20 devoirs
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Il y a 8 modules dans ce cours
Dans ce module, nous présenterons ce cours et donnerons un bref aperçu de ce que vous apprendrez. Nous fournirons un contexte sur les rapports cliniques dans R et la motivation pour le récent changement dans les tendances de l'industrie pour le soutien des outils open-source. Nous décrirons les défis des pratiques actuelles de programmation statistique et les avantages de l'application d'outils Open Source, et nous fournirons des ressources supplémentaires pour en savoir plus.
Inclus
1 vidéo1 lecture1 sujet de discussion
Dans ce module, nous aborderons plusieurs sujets importants liés aux essais cliniques de phase 3 et aux données cliniques. Nous commencerons par une brève introduction aux essais de phase 3 et discuterons du type de données collectées au cours de ces essais. Ensuite, nous donnerons un aperçu de deux modèles de données couramment utilisés pour traiter les données des essais cliniques, à savoir SDTM et ADaM. Ensuite, nous nous pencherons sur le processus de préparation d'un dossier de soumission de données aux autorités sanitaires, en nous concentrant plus particulièrement sur la Food and Drug Administration (FDA) aux États-Unis. Nous étudierons les exigences et les lignes directrices relatives à la soumission de données d'essais cliniques à la FDA. Enfin, nous conclurons ce module en résumant notre compréhension du flux de données cliniques, en soulignant les points clés que nous avons abordés tout au long du cours.
Inclus
6 vidéos1 lecture1 devoir
Dans ce module, nous présenterons une introduction au modèle de modélisation des données de l'étude (ou SDTM) en donnant le contexte et en soulignant l'importance de ces modèles de données pour les essais cliniques. Nous explorerons les différents Mapping (R) de données SDTM pour les données CRF et non-CRF. Enfin, nous donnerons un aperçu de la programmation des SDTM sur R.
Inclus
4 vidéos1 devoir
Dans ce module, nous explorons ce que sont les ensembles de données de modèles de données d'analyse (ADaM), les 3 structures d'ADaM, et comment créer des ADaM dans R en cours d'utilisation (Package (R)).
Inclus
16 vidéos4 lectures4 devoirs
Dans ce module, nous explorons ADaM et R à l'aide des packages Pharmaverse, une étape plus loin. Nous nous concentrerons sur la Structure des Données d'Occurrence ADaM connue sous le nom d'OCCDS en utilisant l'exemple de l'ensemble de données d'analyse des événements indésirables (ADAE). Nous verrons ce qu'est un OCCDS, les événements indésirables, et comment créer un ADAE en utilisant {admiral} et d'autres packages R Pharmaverse. Comme vous allez suivre cette formation avec une approche pratique, lorsque vous travaillez dans R, veuillez d'abord suivre les instructions d'installation ici pour vous assurer que vous utilisez la même version de R et les mêmes packages R nécessaires à la fois pour la formation et pour le quiz à la fin. Vous pouvez effectuer les étapes 1 à 6 maintenant : https://hua.dididi.sbs/learn/hands-on-clinical-reporting-using-r/supplement/enxGp/adae-quiz-resources (copier et coller si nécessaire), puis suivre la formation. Une fois que vous aurez atteint le quiz, vous pourrez commencer à partir de l'étape 7.
Inclus
36 vidéos2 lectures8 devoirs
Dans ce module, nous présentons les concepts de génération de résultats utilisés à des fins réglementaires, et les paquets NEST en particulier. Nous montrons comment vous pouvez utiliser NEST efficacement pour créer et personnaliser vos tableaux, listes et graphiques (TLG) pendant les rapports cliniques et nous présentons le TLG-Catalog pour faciliter la génération de sorties à l'aide de nos paquets. Nous expliquerons les avantages de l'Open Source et les efforts de collaboration de l'industrie en matière de rapports cliniques.
Inclus
36 vidéos2 devoirs
Dans ce module, nous discuterons des avantages de l'utilisation de données en cours d'utilisation pour les rapports cliniques. Nous présenterons la famille de packages R teal et nous nous familiariserons avec les principales fonctionnalités offertes par ce cadre. Enfin, nous apprendrons à développer une application interactive au niveau de la production en utilisant les modules teal pour l'examen des données, les analyses de sécurité et d'efficacité.
Inclus
26 vidéos1 lecture4 devoirs
Dans ce dernier module, nous passerons brièvement en revue le cours et suggérerons les prochaines étapes de votre parcours d'apprentissage.
Inclus
1 vidéo
Instructeurs



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Statut : Prévisualisation
Statut : Essai gratuitUniversity of Colorado System
Statut : Essai gratuitStanford University
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